Документальные издания:
- «Совершенно секретно»: Лубянка – Сталину о положении в стране. 1922–1934 гг. Тт. 1–10. М., 2000–2017 гг.
- Советская деревня глазами ВЧК–ОГПУ–НКВД. Тт. 1–5.
- Верховный правитель России: документы и материалы Следственного дела А.В. Колчака. М., 2003.
- Варшавское восстание 1944 в документах из архивов спецслужб. Варшава–Москва, 2007. 1450 с. (Совместно с Институтом Национальной памяти Республики Польша)
- Генералы и офицеры вермахта рассказывают… Документы следственных дел немецких военнопленных. 1944–1951. М., 2009.
- Власть и общество. Российская провинция. 1917–1991 гг. Т. 1–6. М.–Н.Новгород, 2000–2010.
- Зимняя война. 1939–1940 гг. Исследования. Документы. Комментарии. М.: ИКЦ Академкнига, 2009.
- Остракизм по-большевистски. Преследование политических оппонентов в 1921–1924 гг. М., 2010. 800с.
- Тюремная одиссея Василия Шульгина. Материалы следственного дела и дела заключенного. М., 2010. 480 с.
- Шахтинский процесс 1928 г.: подготовка, проведение, итоги: в 2 кн. Кн. 1. М.: Российская политическая энциклопедия (РОССПЭН), 2010. 975 с.: ил. — (Архивы Кремля).
- Вермахт на советско-германском фронте: Следственные и судебные материалы из архивных дел немецких военнопленных 1944-1952. М.: ООО «Книжница»: ЗАО «Русский путь», 2011. (ответ. ред.).
- Великая Отечественная война. 1941 год: Исследования, документы, комментарии. М., 2011.
- Великая Отечественная война. 1942 год: Исследования, документы, комментарии. М., 2012.
- Великая Отечественная война. 1943 год: Исследования, документы, комментарии. М., 2013.
- Великая Отечественная война. 1944 год: Исследования, документы, комментарии. М., 2014.
- «Великая Отечественная война. 1945 год: Исследования, документы, комментарии». М., 2015.
- Тюремные записки С.П. Мельгунова. 1920 год: сб. док. М., 2015.
- ЭПРОН. Документы по истории Экспедиции подводных работ особого назначения при ОГПУ СССР (1923-1931): архивные документы и материалы /ответ. ред. В.С. Христофоров. М.: Граница, 2015.
- Госбезопасность в битве за Москву. Документы, рассекреченные ФСБ России / ответ. ред. В.С. Христофоров. М.: Издательский дом «Звоница-МГ», 2015. 526 с. - (Серия «XX век: Лики. Лица. Личины.»).
- ВЧК (1917-1922): к столетию создания: Сборник статей и документов / отв. ред. В.С. Христофоров; составители Бережанская И.Ю.; Хозлов Д.Ю. - М.: ИРИ РАН, 2017. 952 с;
- Сионистские партии и организации в СССР. 1920-е гг.: в 2 кн. М.: Политическая энциклопедия, 2019 (Политические партии России. Конец XIX – первая треть XX века. Документальное наследие) / Ответ. ред. З. Галили, В.С. Христофоров.; составители И.Ю. Бережанская, Н.М. Перемышленникова). Кн. 1. 1039 с. Кн. 2 855 с.
- Монголия в документах архивов ФСБ России (1922-1936 гг.): Сборник документов / Ред. колл.: К.В. Орлова, В.В. Гайворонский, С.Л. Кузьмин, В.С. Христофоров. - М.: ИВ РАН, 2019. 528 с.
Монографии:
- Христофоров В.С. Сталинград. Органы НКВД накануне и в дни сражения. М., 2008.
- Христофоров В.С. Афганистан. Правящая партия и армия 1978–1989. М., 2009.
- Зимняя война. 1939–1940 гг. Исследования. Документы. Комментарии. (коллективная монография, авторы – А.Н.Сахаров, В.С. Христофоров, Ю.Л.Дьяков, Л.П. Колодникова, Т. Вихавайнен, Т.С. Бушуева, О. Маннинен. М.: ИКЦ Академкнига, 2009.
- Бушуева Т.С. К 70-летию начала Второй мировой войны «Халхин-Гол. Исследования. Документы. 2009.
- Великая война и великая Победа народа. 1941–1945 гг. (коллективная монография, члены редколлегии и составители – А.Н.Сахаров, В.С. Христофоров, Л.П. Колодникова, Т.С. Бушуева). В 2-х томах. М.: ИКЦ Академкнига, 2010.
- К 70-летию начала Второй мировой войны. Исследования. Документы. Комментарии. (коллективная монография, авторы – А.Н.Сахаров, В.С. Христофоров, Ю.Л.Дьяков, Л.П. Колодникова, Т.С. Бушуева, А.В. Серегин); М., 2009.
- Колодникова Л.П. Советское общество 20-х гг. ХХ в. По документам ВЧК–ОГПУ. М.: Наука, 2009.
- Христофоров В.С. Органы госбезопасности СССР в 1941–1945 годах. М.: Издательство Главного архивного управления города Москвы, 2011. 432 с.
- Христофоров В.С. История страны в документах архивов ФСБ России М.: Издательство Главного архивного управления города Москвы, 2013.
- Христофоров В.С. КГБ СССР в Афганистане 1978-1989 гг. (К 25-летию вывода советских войск из Афганистана). М.: Издательство Главного архивного управления города Москвы, 2014.
- Христофоров В.С. «Секреты Российского флота. Из архивов ФСБ / В.С. Христофоров, А.П. Черепков. - М.: Вече, 2014. 448 с. : ил. (Военные тайны XX века).
- Христофоров В.С. Контрразведка ВМФ СССР. 1941-1945 / В.С. Христофоров, А.П. Черепков, Д.Ю. Хохлов. – М.: Вече, 2015. 416 с. (Вся правда о войне).
- Христофоров В.С. Афганистан: военно-политическое присутствие СССР 1979-1989 гг. М.: ИРИ РАН, 2016. 544 с.
- Христофоров В.С. СССР - Финляндия: противостояние 1941-1944 гг. Москва: ИРИ РАН, 2018. 440с.
- Христофоров В.С. Советские спецслужбы открывают Восток. М.: РГГУ, 2019. 300 с.
- Бугай Н.Ф., Бушуева Т.С. С.К. Бушуев. Ученый. Дипломат. Патриот. Монография. М., 2018. МПГУ. 146 с.
- Бушуева Т.С. Общественные настроения в Красной армии. 1920-е–1934 г.: монография / Т.С. Бушуева. – Москва: МПГУ, 2020. 444 с.