Михаил Борисович Булгаков окончил исторический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова в 1967 г. В 1968-1972 гг. работал младшим научным сотрудником Института славяноведения АН СССР. В 1972 г. перешел в Институт истории СССР АН СССР в Лабораторию по применению математических методов в исторических исследованиях (руководитель – Л.В. Милов). С 1986 г. по 2010 г. работал в Центре истории народов России и межэтнических отношений Института российской истории РАН сначала в должности старшего, с 2007 г. – ведущего научного сотрудника. В 2002–2010 гг. он исполнял обязанности ученого секретаря Центра.
Научные интересы Михаила Борисовича были весьма обширны, но на протяжении всей своей исследовательской деятельности он сохранял неизменный интерес к истории русского города XVII века: вопросам демографии, торговой и промысловой жизни городского населения, самоуправлений, государственных служб и повинностей, социальной категоризации населения. Михаил Борисович также уделял внимание вопросам источниковедения писцовых, переписных, таможенных и кабацких книг XVII в. и актового материала, отражающего состояние и развитие экономики русского города. Он занимался изучением народов Европейского севера России XVII в. (коми, карел и др.) и истории Украины XVII–XIX вв.
Михаил Борисович внёс весомый вклад в развитие российской исторической науки. В списке его научных трудов более 200 публикаций – статей, очерков, монографий. В Институте российской истории ученый создал свои основные труды: «Организация мелких откупов в России первой половины XVII в.» (1997), «Государственные службы посадских людей в XVII веке» (2004), «Народы Европейского Севера России в XVII веке: управление и хозяйство» (2008). Он был соавтором (автором глав) таких коллективных монографий, как «Национальные окраины Российской империи. Становление и развитие системы управления» (1998), «Русское население национальных окраин России XVII-XX вв. (2000)», «Российская многонациональная цивилизация: Единство и противоречия» (2003), «Русские в Евразии XVII–XIX вв. Миграции и социокультурная адаптация в иноэтничной среде» (2008).
Михаил Борисович был целеустремлённым наставником для начинающих исследователей в лучших традициях российской школы исторического просвещения и воспитания.
В сердцах его близких и родных, коллег и учеников он навсегда останется глубоким и отзывчивым человеком.
Мы навсегда сохраним память о Михаиле Борисовиче Булгакове, благодарность за его труды и наставничество.